Предполагаем, не подавалось заявление по форме N Р13014.
За несвоевременное представление сообщения по форме С-09-3-2 организацию могут оштрафовать на 200 рублей, а её руководителя — на 300–500 рублей (п. 1 ст. 126 НК РФ, ч. 1 ст. 15.6 КоАП РФ).
Порядок закрытия филиала юрлица зависит от того, есть ли сведения о нем в уставе или нет.
Если сведения о филиале содержатся в уставе, то процедура закрытия осуществляется в порядке внесения изменений в устав. Для этого:
1) оформите изменения в устав в виде отдельного документа с изменениями или в виде новой редакции устава;
2) примите решение о закрытии филиала и утверждении изменений в устав (устава в новой редакции). Его принимает орган юрлица, в чью компетенцию входит решение данного вопроса;
3) подготовьте заявление по форме N Р13014 и сообщение по форме N С-09-3-2, а также иные документы (решение о внесении изменений в устав, устав в новой редакции или изменения к нему);
4) уплатите госпошлину в размере 800 руб. (пп. 3 п. 1 ст. 333.33 НК РФ, пп. «г» п. 1 ст. 17 Закона о госрегистрации юрлиц и ИП). Платить госпошлину не нужно, если документы направлены в регистрирующий орган в электронной форме;
5) подайте пакет документов в налоговый и регистрирующий органы;
6) получите документы, подтверждающие закрытие филиала, и зарегистрированный устав.
Если сведения о филиале не содержатся в уставе, то процедура закрытия осуществляется в порядке внесения изменений в сведения о юрлице, содержащиеся в ЕГРЮЛ, а именно:
1) примите решение о закрытии филиала. Его принимает орган юрлица, в чью компетенцию входит решение данного вопроса;
2) подготовьте заявление по форме N Р13014 и сообщение по форме N С-09-3-2;
3) подайте документы в налоговый и регистрирующий органы;
4) получите документы, подтверждающие закрытие филиала.
Для регистрации закрытия филиала заполните заявление по форме N Р13014 (независимо от того, куда вносятся изменения — в устав или в ЕГРЮЛ) и сообщение по форме N С-09-3-2.
В заявлении заполните титульный лист, лист Л (в количестве, соответствующем числу закрываемых филиалов) и лист П со сведениями о заявителе.
Заполняя заявление, руководствуйтесь общими и специальными положениями Требований к оформлению документов, представляемых в регистрирующий орган.
В сообщении по форме N С-09-3-2 заполните страницу 001 и страницу со сведениями о закрываемом филиале в количестве, соответствующем числу закрываемых филиалов (п. 12 Приложения N 10 к Приказу ФНС России от 04.09.2020 N ЕД-7-14/632@).
Заполнить сообщение достаточно просто. Внимательно заполняйте его поля в соответствии с утвержденным Порядком.
Сообщение по форме N С-09-3-2 подается в налоговую инспекцию, в которой юрлицо стоит на учете (пп. 3.1 п. 2 ст. 23 НК РФ).
Заявление по форме N Р13014 подается в налоговую инспекцию по месту нахождения или в специализированную инспекцию по месту нахождения юрлица, если в субъекте, в котором находится юрлицо, имеется отдельная инспекция, занимающаяся вопросами регистрации (п. 5 ст. 5, п. 1 ст. 18 Закона о госрегистрации юрлиц и ИП).

Документы: пп. 3.1 п. 2 ст. 23, НК РФ {КонсультантПлюс}; Готовое решение: Как закрыть филиал или представительство юридического лица (КонсультантПлюс, 2025) {КонсультантПлюс}