Применяются ли правила о ликвидации (отказ в регистрации если имеется не погашенный долг по мотиву того что данная процедура должна проходить в рамках дела о банкротстве или не отражение данного долга в ликвидационном балансе присоединяемого лица) одного юридического лица в отношении присоединяемого юридического лица (лица, которое присоединяется к другому)?

Нет, правила о ликвидации, предусматривающие отказ в регистрации при наличии непогашенного долга или неотражение данного долга в ликвидационном балансе, не применяются к присоединяемому юридическому лицу в рамках реорганизации.
Обоснование:
При реорганизации в форме присоединения обязательства присоединяемого юридического лица переходят к присоединяющей организации (п. 2 ст. 58 ГК РФ). Ликвидация присоединяемого юридического лица не является основанием для включения переданных сумм долга в состав налогооблагаемых доходов присоединяющей организации. В результате реорганизации в отношении присоединяемого юридического лица в ЕГРЮЛ вносится запись о прекращении деятельности (п. 4 ст. 57 ГК РФ).
Однако, если впоследствии в рамках банкротства юридического лица, к которому присоединилось ООО, будет установлено, что полное погашение требований кредиторов невозможно вследствие совершения ООО или его контролирующими лицами правонарушения, ответственность с единоличного исполнительного органа ООО и его контролирующих лиц не снимается (пп. 3 п. 2, п. 5 ст. 61.11 Закона о банкротстве).
Таким образом, при реорганизации в форме присоединения не требуется погашение задолженности по налогам и по расчетам с контрагентами перед внесением записи о прекращении деятельности присоединяемого юридического лица в ЕГРЮЛ.

Документы: Готовое решение: Как погашаются требования кредиторов при ликвидации должника-юрлица (КонсультантПлюс, 2026) {КонсультантПлюс}, Готовое решение: Как осуществляется правопреемство при реорганизации юрлица (КонсультантПлюс, 2026) {КонсультантПлюс}, Готовое решение: Как реорганизовать ООО в форме присоединения (КонсультантПлюс, 2026) {КонсультантПлюс}