Организация безвозмездно за счет собственных средств обучает физических лиц, не являющихся сотрудниками организации А. Организация А имеет лицензию на оказание образовательной деятельности и является коммерческой организацией. Обучающиеся ничего не платят организации. Будет ли возникать для физических лиц в данной ситуации натуральной доход, подлежащий обложению НДФЛ или для них, будет действовать льгота и НДФЛ с данных образовательных услуг возникать не будет?

Облагаемый НДФЛ доход у ФЛ в рассматриваемой ситуации не возникает.
Как правило, когда организация оплачивает какие‑либо услуги в интересах физического лица, у последнего возникает доход в натуральной форме, подлежащий обложению НДФЛ (< п. 2 ст. 211, НК РФ {КонсультантПлюс}>).
Однако налоговое законодательство предусматривает исключение: согласно п. 21 ст. 217, НК РФ {КонсультантПлюс} плата за обучение физлица — в том числе не являющегося сотрудником организации — по основным и дополнительным образовательным программам не облагается НДФЛ. Это касается обучения как в российских организациях, имеющих право вести образовательную деятельность, так и в иностранных учебных заведениях, обладающих соответствующим правом.
Ключевые моменты, которые в вашей ситуации соблюдены:
· Организация А сама оказывает образовательные услуги (у неё есть лицензия).
· Обучение проходит по дополнительной профессиональной программе — это прямо подпадает под льготу.
· Не имеет значения, что обучающиеся не являются сотрудниками организации А.
· Не имеет значения, что оплата идёт за счёт собственных средств организации А, а не из какого-то специального фонда.
Минфин России в своих разъяснениях (например, в Вопрос: Об НДФЛ при обучении за счет средств образовательной организации. (Письмо Минфина России от 19.12.2019 N 03-04-06/99474) {КонсультантПлюс}, а также в более поздних) подтверждал: если организация, имеющая лицензию, за свой счёт оплачивает обучение физлица (в том числе не сотрудника) по соответствующей программе, у обучающегося не возникает облагаемого дохода. По сути, закон рассматривает это не как доход физлица, а как реализацию организацией своего права снижать стоимость услуг за счёт собственных средств.
Документы: Вопрос: Об НДФЛ при обучении за счет средств образовательной организации. (Письмо Минфина России от 19.12.2019 N 03-04-06/99474) {КонсультантПлюс}; п. 21 ст. 217, НК РФ {КонсультантПлюс}; Вопрос: Об НДФЛ с дохода в виде сумм частичной оплаты организацией стоимости обучения налогоплательщиков, в частности по дополнительным образовательным программам. (Письмо Минфина России от 11.03.2024 N 03-04-05/21216) {КонсультантПлюс}; Готовое решение: Какие компенсации облагаются и не облагаются НДФЛ (КонсультантПлюс, 2026) {КонсультантПлюс}